This is a study-lab course in which topics are presented by short texts, practical sessions are introduced and explained and assignments are completed  by students. It is made of seven units: three theoretical units, each followed by a practical unit. In order to exemplify the use of the proposed  methods and models, a final unit is devoted to a case study on benthic macroinvertebrates in the Po River delta, providing the data, the R code and some interpretative comments. Practical units are based on the use of the R software, with purpose-specific libraries and functions. Quizzes are given following every unit, together with practical assignments to be addressed with the R software.

After this introductory unit, the first practical unit will be devoted to briefly introduce the R software. Biodiversity partitioning will be the subject of the next two units, where methodology and software for γ , α and β diversity profiling will be described and applied to a sample data set. The theory behind mixed effects modeling will be sketched and applied to investigate the variation of biodiversity measures. The last practical unit exemplifies the use of the R implementation of mixed effects modeling routines with data from ecological surveys. Finally we will summarize and exemplify the proposed methods with the complete analysis of a case study.

Il presente è un corso pratico dove gli argomenti sono descritti con testi brevi, le sessioni pratiche sono introdotte e spiegate in modo che lo studente possa procedere al completamento degli esercizi riepilogativi per ogni unità. È costituito da sette unità: tre unità teoriche, ognuna delle quali seguita da un'unità pratica. In modo da poter esemplificare l'uso dei metodi e modelli proposti, un'unità finale è dedicato ad un case-study sugli microinvertebrati bentici del delta del fiume Po, fornendo i dati, il codice per R ed alcuni commenti interpretativi. Le unità sono basati sul uso del software R, unito ad alcune librerie e funzioni dedicate al caso in esame. Ogni unità è seguita da una serie di tests ed esercizi pratici riguardanti l'uso del software R.

Dopo una prima unità introduttiva, la prima unità pratica sarà dedicata ad una breve introduzione del software R. Il partizionamento della biodiversità sarà oggetto di studio delle prossime due unità, dove saranno descritte le metodologie ed il software per la profilazione delle γ, α e β diversità, applicandole ad un dataset d'esempio. Sarà descritta la teoria della modellazione ad effetti misti, che sarà applicata per indagare la variazione delle misure della biodiversità. L'ultima unità pratica esemplifica l'uso delle routine di di modellazione ad effetti misti implementate in R con dati ecologici sperimentali. Infine si riassumono i metodi proposti e saranno utilizzati per un'analisi completa di un caso di studio.